
2024年9月由无锡林果业社会张万刚教援创业团队在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱动物为该研究提供了亚硝基化淡化组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
英文版题目:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
论文期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
2026年印象细胞因子:5.7
刊登日期:2024年9月
的客户政府部门:南京农业大学
探索材质:蛋白
拜谱保证技术设备:亚硝基化修饰组学
技木线路:
一、实验然而
01.Caspase-3吸附性
现今尚不了解清楚NO对caspase-3的可以抑制做用可否归因于NO介导的S-亚硝基化,不一氨水浓度均值的GSNO有所作为外源性NO批发商,以引发caspase-3的身体之外S-亚硝基化。結果展现,与并没有GSNO的组相比之下,100、200和400μM GSNO组的caspase-3生物不错调低(图1),与事先新闻报道共同。GSNO正确处理调低caspase-3生物的不确定性病因仍存在不足展现。
图1 的不同含量的GSNO处置对caspase-3灵活性的不良影响
02.Caspase-3的S-亚硝基化能力
钻研Caspase-3的亚硝基化阶段,以指出GSNO对Caspase-3的化学反应性。经GSNO工作后,检查到caspase-3蛋白酶S-亚硝基化难度增多(图2)。这个没想到反映出,外源性GSNO培训可好诱导型caspase-3的休外S-亚硝基化。使人诧异的是,在没GSNO会有的比对组中检查到某个忽闪的S-亚硝基化带,这反映出caspase-3机会造成内源性的S-亚硝基化。还有,本钻研中caspase-3的S-亚硝基化阶段较高,而caspase-3的渗透性降低,这与之后的钻研不同。而是,caspase-3的特女性朋友S-亚硝基化呈现位点尚不很明白,还需进几步的探讨。
图2 GSNO外理对caspase-3S-亚硝基化级别的不良影响
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化突显组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的字段。橙色标注的字段透露S-亚硝基化肽,红色的标注的C透露S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱图
04.S-亚硝基化Caspase-3吸附结淀粉酶
结淀粉酶做为属于重点的受损组织细胞骨架淀粉酶,在维护肌受损组织细胞框架的框架全面性和收缩毛孔性因素起关键点影响,科学研究S-亚硝基化caspase-3对结淀粉酶挥发塑料的敏锐性具备着重点重大意义。与Std(未用胱天淀粉酶酶-3和GSNO孵育的一开始肌合成人造纤维淀粉酶)组比较,0 μM GSNO组(肌原合成人造纤维和caspase-3的孵育,无GSNO)的全面结淀粉酶占比更为很明显下降,的提示caspase-3对结淀粉酶具备着内在的淀粉酶溶解实力。在GSNO孵育后,全面结淀粉酶的占比很明显增长(P < 0.05)。除外,当GSNO氧浓度变高时,全面结淀粉酶的占比持继上浮(P < 0.05)(图5)。一项挖掘体现了,SNO淡化的caspase-3以水准依耐的行为能够抑制结淀粉酶的挥发塑料。
图5.S-亚硝基化caspase-3溶解结蛋白酶
05.S-亚硝基化Caspase- 3吸附肌钙蛋白质-T
肌钙球蛋清质-T (TnT)是原肌球球蛋清质调接承担责任相关肌肉收宿的细细的的须要肌原玻纤板材料球蛋清质。TnT的可光光化学降解塑料结构特征是监测到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化必备条件下,caspase-3对TnT的可光光化学降解塑料环境右图6如下,与Std组(包含caspase-3和GSNO的肌原玻纤板材料)相较,caspase-3组中30 kDa TnT情节可观多,显示caspase-3陆续参与了TnT的可光光化学降解塑料,因此,caspase-3与GSNO的孵育关系到30 kDa TnT骤降。在100和200 μM GSNO组相互不监测到强烈的对比分析(P > 0.05),而当GSNO的含量做到400 μM 时,该情节可观仰制(P < 0.05)。那些发展显示了SNO掩盖的caspase-3对TnT可光光化学降解塑料的仰制成用。结球蛋清质和TnT是caspase-3的皮肤敏感底物,而GSNO加工下降caspase-3的化学活化几率关系到肌原玻纤板材料球蛋清质可光光化学降解塑料因素下降。与此同时表明,NO帮助的S-亚硝基化会采用掩盖半胱氨酸残基来调接caspase-3的化学活化,借以进一次关系到其对结球蛋清质和TnT的球蛋清质油脂水解力,于是关系到羊肉品质保证。
图6. S-亚硝基化caspase- 3挥发肌钙蛋白酶-T
二、总结ppt
本科学研究重在浅析S-亚硝基化对caspase-3呈现的影晌非常陆陆续续对牛羊肉肌原合成化学纤维离体降解塑料的影晌。淀粉酶酶S-亚硝基化都可以呈现caspase-3的半胱氨酸残基,然后产生caspase-3活力性有效降低,进十步抑止了其对牛羊肉肌原合成化学纤维淀粉酶酶的淀粉酶酶电离作用。三、拜谱工作小结
学习应用了酶活测得,亚硝基化遮盖组学钻研,WB等测量法律手段,发觉球球淀粉酶S-亚硝基化能够 遮盖caspase-3的半胱氨酸残基,这诱发了caspase-3活性氧的大大减少,并举步能够抑制了其对牛羊肉肌原纤维材料球球淀粉酶的球球淀粉酶溶解业务能力。本学习为表示球球淀粉酶质亚硝基化对肉肥的房产调控机能供给新一个新的上帝视角。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的球营养素组学、体现球营养素组学、分解组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸系统物品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺酸性反应、total被氧化重现、自由巯基,欢迎大家咨询!
决定性文献综述:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663