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首页 > 拜谱生物 > 干货分享 > 网格药学学揭露草酸钙肾结石防氧化应激性和细菌感染损坏缘由

网络药理学揭示草酸钙肾结石氧化应激和炎症损伤机制

发布时间:2024-08-02
草酸钙(CaOx)肾结石是泌尿操作系统最易见的慢性病组成。肾安排中CaOx结晶过呈现饱和状态磨合会造成 肾小管细胞核受损和凋亡,要点在于造成 肾结石的组成。短链油脂酸由肠子内好氧池细菌病毒发哮营养饮食棉纤维会产生,不光在局部性肠子天然屏障中激发功效,同时在操作系统水平面上也激发要点功效。进来,丁酸是最多种多样的短链油脂酸,具免疫细胞缓和和免疫细胞缓和功效,本探究探究丁酸对CaOx肾结石的功效以及未知靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究,华山专科医院泌尿整形外科吴忠专家教授、周子健院士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果,7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠先生、周子健博后在Food and Chemical Toxicology(IF=4.3)上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤,并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因,最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱微生物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作,提供了网路临床药理学售后服务,助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点,为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

句子命名:Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9(Food Chem Toxicol.,IF=4.3,2023.07) 朋友行业:华山医疗 探索男朋友:大鼠、HK-2上皮细胞 分组名资讯:對照组(Con)、模板组(Model)和丁酸钠组(NaB) 拜谱展示的技术:无线网络药剂学学探测

想法方案图

科学研究后果

理论科学研究工作员要搭配大鼠绘图,顺利通过生理变化血生化指标英文和聚集病检学上色等理论科学研究机制出现丁酸能能减低CaOx绘图大鼠肾CaOx结晶的达成和破损,可以改善CaOx绘图大鼠的慢性炎症破损和阳极脱色化学物质的过渡表述。还有就是,丁酸还可调节草酸诱导性的HK-2神经元核破损、阳极脱色应激状态和神经元核凋亡。 为探求丁酸构成和靶染色体组电脑wifi互联网信息,探析人数从PubChem抓取丁酸和丁酸酯的二维和3d构成(图1A)。确认PharmMapper数据表格源资料库和Uniprot数据表格源资料库治理 后共筛分出116个丁酸靶染色体组供进几步了解。将染色体组表单接入STRING数据表格源资料库,来进行PPI电脑wifi互联网信息了解。Cytoscape提出了筛选的前20的核心靶染色体组的详实电脑wifi互联网信息图,还包括CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2(图1B)。这核心染色体组与电脑wifi互联网信息中的别的染色体组均特征出相应的有关于性,讲解这染色体组概率表现着协同管理使用。GO和KEGG了解反映了丁酸核心染色体组的有关于条件和海洋物理学效果(图1C)。核心染色体组重点与类固醇肾上腺素回复、防防氧化应激生理反应状态回复、可溶性氧神经元对类固醇肾上腺素热血的现象和对弱酸性化学物品物品的现象有关于。以上所讲,这核心染色体组重点陆续参与了防防氧化应激生理反应状态和对可溶性氧的海洋生物技术现象过程中,是肾结石构成机制化中至关必要的条件,这反映丁酸概率在肾结石中表现必要使用。

图1| 丁酸架构与靶DNA微信网络定量分析(图源:Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进一部挑战丁酸对CaOx肾结石确实切靶人类人类DNA,学习人工工资运用GEO数据资料文件库对GSE73680中安全健康差表与CaOx肾结石病人的人类人类DNA差异化做出了学习。差表组与CaOx结石病人的偏态能力差异化传达出人类人类DNA(DEGs)检测准则为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共需求到3783个人类人类DNA突发偏态變化,之中3379个(89.4%)人类人类DNA传达出调涨,404个(10.6%)人类人类DNA传达出下跌(图2A)。对DEGs做出聚类分析法算法探讨,热图提示了前10个被选中DEGs的二维上下分层聚类分析法算法显著特点(图2B)。随即,学习人工工资利用GeneCards数据资料文件库人工工资签定了370个或许与CaOx肾结石想关的人类人类DNA,优化前20位的预测分析人类人类DNA以及想关性评估下图2C下图。要想查到丁酸缓解CaOx肾结石的首要靶点,学习人工工资将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石想关人类人类DNA加工处理赢得了一大个Venn图。结果,CYP2C9被确立为丁酸关系CaOx肾结石的意向靶点(图2D)。显然,学习人工工资还做出了丁酸与CYP2C9的分子式联结,CYP2C9的几个氨基残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸主动用,氢键能为4.2 kcal/mol(图2E)。 在回收利用网洛药学学預測CYP2C9是丁酸的影响CaOx肾结石的靶DNA后,探索人数还经由血神经细胞实验操作表明了CYP2C9可减小草酸诱导型的HK-2血神经细胞的ROS情况、慢性炎症挫伤和凋亡。

图2| 占多数据库联席探讨预測CYP2C9是丁酸目的于CaOx肾结石的靶表观遗传

论述的结果

本探究第一个出现 丁酸在身体之外和内部均能减缓CaOx肾结石绘图的阳极氧化反应应激性反应和疾病神经软组织软组织损伤,很快可以在网上临床药剂学学挑选有丁酸影晌CaOx肾结石的不确定性靶点——CYP2C9,最好可以在组织实验操作查证CYP2C9在草酸盐分析的HK-2组织ROS含量、疾病神经软组织软组织损伤和凋亡。这样出现 表示丁酸能够可以在减缓CYP2C9来减缓CaOx肾结石的阳极氧化反应应激性反应,缓解疾病神经软组织软组织损伤。某些工作中拜谱海洋生物学保证了网上临床药剂学学技木安全服务项目,然而拜谱海洋生物学可加快发育成熟建立健全的表观遗传组学、球蛋白质含量组学、代谢转化组学等多个学物品及技木安全服务项目,欢迎辞致電咨询公司! 决定性期刊论文:Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.
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