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新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

不停做为化工公司物料而被熟记的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“分解废弃物”成“遗迹小碳原子”的坚辛艰辛同类,到最近近10数年才被察觉到其注重的生物制品学特点,就此“平躺农奴把大合唱”,特殊是在免疫系统支原体感染性患病研究分析的领域内独树一帜。多余篇小作文新闻报导了在各式支原体感染性患病的节肢动物绘图中给以衣康酸或其药剂学体现ip产业物制品的治疗方法益处,并察觉到其未知靶点。关与衣康酸的“前生”与“今生今世”,具体情况见微信文章《乳酸的逆袭女神弟弟——衣康酸!这篇跟大家清楚衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康碱化呈现淀粉酶组学产品,实现1000+高妙度体现位点查出,平衡再现特色靶点,全位置生信概述解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“察觉”到“认证”全过程安全服务,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、实验报告操作流程

02、场地实测动态数据

03、经“点”逆转

在测量数据报告中,验出2个学术论文中消息的特色靶点也有衣康酸表达语位点,如第1 个被表明的衣康酸共价表达语血清质质KEAP1,也有糖酵解信号通路中的3个要点酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,还有炎性小体根据血清质质NLRP3和血细胞损伤的过程 中的要点血清质质RIPK3等,其质谱图有以下几点图如图所示。

04、成品特征

1.多个质控

业务化炎症因子聊天电极孵育、SDS-PAGE查测、WB核实、样表有关于性数据分析等双地方查测,有效确保楼盘报告可靠的性。

2.高稳定性质谱医疗仪器app平台

在Orbitrap Astral全新新一批高签别质谱仪作明佛母心咒下,建立衣康酸性反应遮盖位点及蛋白酶鉴定会新程度,助力器地理学探究新会发现。

3.全方案一坐式产品

基本概念拜谱生物制品健全的试验软件平台,可供应“细胞膜训练→测试探针孵育→WB论文监测→举重若轻度衣康酸性反应淡化论文监测→独有生信讲解→某些位点PRM认证”全程序保障,省时省钱更先问。

05、探讨知识(区域)

06、拜谱生物方向盘

PART 2、参考文献qq分享

期刊论文一

英文版关键词:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

中文名字主题词:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

论述内部:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

参考文献二

日语文章标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

英文版子标题:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

研究探讨玩法:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、拜谱生物衍生品难点

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13兼具有较强的底物切合实力,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生态学衣康酸性反应遮盖组评测参数中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康硝化作用遮盖(下面的图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱个人心得体会

作TCA循环系统中的中基础新陈代谢转化物,衣康酸调试基础新陈代谢转化、天然免役抗体和慢性宫颈炎症互相的能够 能力,为手术治疗方法天然免役抗体慢性宫颈炎症性发病给出了代用手术治疗方法策略。衣康酸节构中的亲电性α,β-不供大于求羧酸节构能对核脂肪酸上的活性酶半胱氨酸残基做烷基化表达(迈克尔加持反映),一种翻意后表达被称之为“衣康酸表达(itaconation)”,借以会影响核脂肪酸功能表,政策调控天然免役抗体回话和基础新陈代谢转化前提条件,为许多种发病药研发团队给出新思绪。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康酸性反应淡化核蛋白组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医疗絕對降钙素原检测靶向药物细胞代谢组(QMT1000)或能量转换新陈代谢转化靶向治疗新陈代谢转化组物料对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

对比学术论文

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
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